همانطور که آگاهید، سامانه ستاد نسبت به دریافت مبالغی از برنده مناقصات اقدام می نموده است که این موضوع مورد اعتراض جدی سندیکای شرکتهای ساختمانی ایران (با اعتراض شرکتهای گوهر رود گیلان، ناورود، کندوان پارس) و پیمانکاران متعدد روبرو گشته است.
سندیکا بر اساس اعتراض و مدارک اعضای خویش بصورتی جدی این موضوع را در شورای گفت و گوی دولت و بخش خصوصی مطرح نموده و منجر به برگزاری جلسه مشترکی با مسئولین و مدیران وزارت صمت و سامانه ستاد گشت که در آن جلسه نیز اعتراضات کارشناسی و ادله قانونی شرح داده شد و مصوبه قانونی دریافت این موضوع صرفا با توافق وزارت صمت و فی مابین وزارت صمت و سامانه ستاد منعقد شده بود.
سندیکا علاوه بر این نیز بارها با ادله قانونی نسبت به این موضوع و غیرقانونی خواندن آن اقداماتی را انجام داده است که در گذشته اطلاع رسانی در این خصوص انجام شده است.
شرکت تعاونی خدماتی پشتیبانی بازنشستگان بانک مسکن نیز همچون سایر بهره برداران از این سامانه، پس از برنده شده در مناقصه ای با نامه سامانه ستاد مبنی بر واریز هزینه مشخص مناقصه و در صورت عدم واریزی تغییر برنده مناقصه روبرو شده و با پیگیری از دیوان عدالت اداری نهایتا منجر به صدور رای غیرقانونی بودن این مصوبه و اخذ این هزینه ها از سوی دیوان عدالت اداری گشته است.
